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多通道玻片掃描儀怎么用的
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長(zhǎng)恒榮創(chuàng)

時(shí)間 : 2024-10-13 12:38 瀏覽量 : 14

多通道玻片掃描儀是一種高精度、高靈敏度的光學(xué)掃描設(shè)備,能夠在單次掃描中采集多個(gè)通道的信息,通常包括明場(chǎng)(brightfield)、熒光(fluorescence)、相差(phase contrast)等多種模式。其強(qiáng)大的成像功能使其廣泛應(yīng)用于病理學(xué)、生命科學(xué)研究、藥物篩選和生物醫(yī)學(xué)工程等領(lǐng)域。在科研工作中,掌握多通道玻片掃描儀的使用方法至關(guān)重要。


一、使用前的準(zhǔn)備工作

1. 環(huán)境要求

確保掃描儀放置在干凈、無塵、無震動(dòng)的實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中。為獲得最佳掃描效果,實(shí)驗(yàn)室的溫濕度應(yīng)保持恒定,避免環(huán)境變化影響光學(xué)系統(tǒng)的穩(wěn)定性。遠(yuǎn)離強(qiáng)磁場(chǎng)或其他電磁干擾源。


2. 設(shè)備檢查

在操作前,檢查多通道玻片掃描儀的光學(xué)系統(tǒng)、機(jī)械部件、軟件和連接情況。確保光學(xué)鏡頭清潔,載物臺(tái)平穩(wěn),燈源(如熒光燈、LED光源等)狀態(tài)正常。若發(fā)現(xiàn)光學(xué)鏡片或樣本載物臺(tái)有灰塵或污跡,需使用專業(yè)清潔工具進(jìn)行清潔。


3. 樣本準(zhǔn)備

準(zhǔn)備好待掃描的玻片樣本。對(duì)于多通道掃描,尤其是熒光通道的樣本,玻片的質(zhì)量至關(guān)重要。確保樣本處理得當(dāng),切片厚度適宜,染色或熒光標(biāo)記均勻,避免染料褪色或熒光淬滅。玻片表面應(yīng)無氣泡、劃痕或灰塵。


二、多通道玻片掃描儀的使用步驟

1. 啟動(dòng)掃描儀

接通電源后,啟動(dòng)多通道玻片掃描儀,并啟動(dòng)配套的軟件。等待設(shè)備自檢完成后,確認(rèn)設(shè)備工作正常。不同型號(hào)的多通道掃描儀啟動(dòng)時(shí)間可能不同,用戶可根據(jù)設(shè)備提示進(jìn)行操作。


2. 軟件設(shè)置

在計(jì)算機(jī)上打開掃描儀配套的軟件界面,準(zhǔn)備進(jìn)行掃描設(shè)置。軟件通常帶有用戶友好的界面,可以調(diào)整多個(gè)通道的參數(shù)。多通道掃描儀通常支持以下設(shè)置:

通道選擇:根據(jù)樣本的類型和實(shí)驗(yàn)?zāi)康?,選擇所需的掃描通道。例如,明場(chǎng)掃描用于觀察組織結(jié)構(gòu),熒光通道可用于識(shí)別熒光標(biāo)記的分子或細(xì)胞,DAPI、FITC、TRITC等不同波長(zhǎng)對(duì)應(yīng)不同的熒光染料。

分辨率設(shè)置:調(diào)整每個(gè)通道的分辨率。分辨率越高,圖像越清晰,但掃描時(shí)間也會(huì)相應(yīng)增加。

掃描模式:可選擇單個(gè)通道掃描或多通道同時(shí)掃描。某些軟件支持預(yù)設(shè)掃描路徑,用戶可以定義需要掃描的區(qū)域或整個(gè)玻片的全景掃描。

焦點(diǎn)調(diào)整:掃描前進(jìn)行自動(dòng)或手動(dòng)對(duì)焦。自動(dòng)對(duì)焦系統(tǒng)會(huì)基于樣本的表面信息調(diào)整焦距,確保每個(gè)通道都能準(zhǔn)確對(duì)焦。


3. 載物臺(tái)裝載玻片

將準(zhǔn)備好的玻片樣本放置在掃描儀的載物臺(tái)上。載物臺(tái)需保持水平,確保玻片平整不移位。多數(shù)多通道玻片掃描儀的載物臺(tái)能夠通過機(jī)械臂或自動(dòng)進(jìn)樣器移動(dòng),實(shí)現(xiàn)批量樣本處理。在載物臺(tái)上固定玻片后,用戶可以通過軟件界面選擇樣本的掃描區(qū)域。


4. 選擇掃描區(qū)域

使用軟件的預(yù)覽功能查看樣本,并選定需要掃描的區(qū)域。如果需要對(duì)整個(gè)玻片進(jìn)行全景掃描,可以選擇全玻片掃描模式。如果只關(guān)注特定區(qū)域,可以選擇局部區(qū)域掃描模式?,F(xiàn)代多通道掃描儀通常允許用戶靈活設(shè)置掃描區(qū)域的大小和形狀。


5. 設(shè)置通道順序

在多通道掃描中,掃描順序?qū)Τ上褓|(zhì)量非常重要。通常,優(yōu)先掃描明場(chǎng)通道,然后再掃描熒光通道。這是因?yàn)闊晒馊玖峡赡軙?huì)隨著掃描光源的照射逐漸褪色,優(yōu)先掃描明場(chǎng)可以避免影響熒光信號(hào)。


6. 開始掃描

確認(rèn)所有設(shè)置正確后,點(diǎn)擊“開始掃描”按鈕。多通道玻片掃描儀將按照預(yù)設(shè)參數(shù)自動(dòng)執(zhí)行掃描過程。掃描儀在X、Y和Z軸方向移動(dòng),逐個(gè)捕捉每個(gè)選定通道下的圖像信息。掃描完成后,軟件會(huì)自動(dòng)將多通道圖像進(jìn)行對(duì)齊和合成。


三、圖像處理與分析

1. 圖像查看

掃描完成后,軟件會(huì)顯示所有通道的圖像。用戶可以通過軟件查看單個(gè)通道的圖像或?qū)⒍鄠€(gè)通道合成在一起進(jìn)行觀察。熒光通道下的圖像可能需要進(jìn)行伽馬校正或亮度調(diào)整,以增強(qiáng)可視性。


2. 圖像拼接

如果進(jìn)行的是全玻片掃描或大區(qū)域掃描,軟件將自動(dòng)將不同區(qū)域的圖像進(jìn)行拼接。拼接算法基于圖像的重疊部分進(jìn)行匹配和對(duì)齊,最終形成無縫的高分辨率全景圖。


3. 多通道圖像合成

在多通道掃描中,軟件可以將不同波長(zhǎng)的熒光圖像與明場(chǎng)圖像進(jìn)行疊加,形成復(fù)合圖像。用戶可以自由選擇疊加方式或調(diào)整各個(gè)通道的透明度,以突出特定標(biāo)記物或組織結(jié)構(gòu)。


4. 分析與存儲(chǔ)

多通道玻片掃描儀軟件通常集成了圖像分析工具,例如細(xì)胞計(jì)數(shù)、區(qū)域分割、熒光強(qiáng)度分析等。用戶可以使用這些工具對(duì)掃描結(jié)果進(jìn)行進(jìn)一步的定量分析。完成分析后,保存圖像和分析結(jié)果。圖像可以存儲(chǔ)為常見格式(如TIFF、JPEG、PNG等),并備份至實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)庫(kù)或云端。


四、注意事項(xiàng)

熒光通道的保護(hù) 熒光染料容易受到光漂白的影響,因此在熒光通道的掃描中,需避免長(zhǎng)時(shí)間曝光??梢酝ㄟ^減少光強(qiáng)、縮短掃描時(shí)間來保護(hù)熒光信號(hào)的完整性。


定期校準(zhǔn) 多通道玻片掃描儀的光學(xué)系統(tǒng)需要定期校準(zhǔn),以確保各個(gè)通道的圖像準(zhǔn)確對(duì)齊,并保持光學(xué)系統(tǒng)的最佳狀態(tài)。校準(zhǔn)工作可以包括對(duì)焦系統(tǒng)的調(diào)整、光強(qiáng)的調(diào)節(jié)以及載物臺(tái)的精確校準(zhǔn)。


數(shù)據(jù)備份 由于多通道掃描的圖像文件通常較大,掃描完成后及時(shí)進(jìn)行數(shù)據(jù)備份非常重要。建議將數(shù)據(jù)保存到多個(gè)存儲(chǔ)設(shè)備或使用實(shí)驗(yàn)室的云存儲(chǔ)平臺(tái),以確保數(shù)據(jù)安全。


設(shè)備維護(hù) 為了保證掃描質(zhì)量,應(yīng)定期清潔掃描儀的光學(xué)鏡片和載物臺(tái)。使用光學(xué)專用清潔劑和無塵布進(jìn)行清潔,避免使用酒精或其他化學(xué)溶劑。定期維護(hù)光源系統(tǒng),確保光源的亮度和穩(wěn)定性。


五、常見問題處理

圖像對(duì)焦不準(zhǔn) 如果發(fā)現(xiàn)某些通道圖像對(duì)焦不準(zhǔn),可以嘗試手動(dòng)對(duì)焦或調(diào)整掃描區(qū)域的自動(dòng)對(duì)焦點(diǎn)。在熒光掃描中,由于不同通道的光學(xué)特性不同,可能需要分別對(duì)每個(gè)通道進(jìn)行對(duì)焦。


熒光信號(hào)弱或褪色 熒光信號(hào)弱可能與樣本染色不均勻或熒光標(biāo)記的濃度低有關(guān)。建議重新染色或增加熒光標(biāo)記的濃度。此外,在長(zhǎng)時(shí)間掃描過程中,可以通過減小光強(qiáng)來延長(zhǎng)熒光信號(hào)的持續(xù)時(shí)間。


掃描速度慢 掃描速度受分辨率、掃描區(qū)域大小和通道數(shù)的影響??梢酝ㄟ^減少掃描分辨率、縮小掃描區(qū)域或選擇部分通道掃描來提高速度。如果設(shè)備允許,可通過更換計(jì)算機(jī)或提高存儲(chǔ)器和處理器的性能來加快數(shù)據(jù)處理。


六、總結(jié)

多通道玻片掃描儀在生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中的廣泛應(yīng)用,得益于其強(qiáng)大的多模態(tài)成像能力。通過自動(dòng)化的操作和高精度的圖像采集,多通道掃描儀能夠?qū)?fù)雜的生物樣本信息快速數(shù)字化,為科研工作者提供豐富的數(shù)據(jù)支持。掌握正確的使用方法,合理設(shè)置掃描參數(shù),并定期進(jìn)行設(shè)備維護(hù),能夠有效提升工作效率,確保圖像質(zhì)量,助力科學(xué)研究和診斷工作。

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